综合科（纪检监察室）
　　协助办领导处理日常工作，负责综合协调和督办工作；负责文电、会务、机要、保密、档案等机关日常运转工作；负责综合性文稿起草、公文核稿、政务信息、宣传工作；负责财务管理、后勤服务、公务接待和固定资产管理等有关行政事务工作；负责人事、离退休干部、党务、计划生育、综合治理等工作；负责机关门户网站建设、电子政务和信息化建设工作；承担省编办委托的政务和公益专用中文域名的注册和管理；负责市直机关事业单位统发工资的编制审核工作；负责市编办的纪检监察工作。
　　研究室（政策法规科）
　　研究全市行政管理体制改革、机构改革、事业单位分类改革和相关领域涉及行政管理体制改革的重大问题；围绕编办重点工作开展全局性、长远性研究和专题调研；参与机构改革方案拟订及组织实施方面的有关工作；组织拟订全市机构编制管理办法措施，协调推进机构编制管理科学化、规范化、法制化建设；承担有关规范性文件的合法性审核和政策规定等征求意见的回复工作；参与综合性文件的起草；配合有关部门做好行政审批制度改革工作。
　　行政机构编制管理科
　　负责研究拟订全市行政管理体制改革和机构改革实施意见；负责研究拟订市直机关机构改革方案并组织实施；审核市直机关"三定"规定并跟踪了解落实情况；负责市直机关机构编制管理工作；负责县市区机构改革方案的审核、报批和备案工作，指导县市区机构改革和机构编制管理工作；审核县市区副科级及其以上行政机构设置、乡镇（街道办事处）行政机构设置和县乡机构编制分类；负责政法专项编制审核管理工作；负责全市行政机关军队转业干部编制审核管理工作；负责产业集聚区管理体制改革工作。
　　事业机构编制管理科
　　研究拟订全市事业单位管理体制改革和机构改革方案及机构编制管理办法，负责事业单位改革和管理的具体工作；拟订全市事业单位人员编制总量控制办法、机构编制标准和人员结构比例；负责市委、市政府直属事业单位和市直机关所属事业单位机构编制管理工作；负责参照公务员法管理事业单位职责的审核工作；审核县市区副科级及其以上事业机构设置、乡镇和街道办事处事业机构设置；负责市直事业单位军队转业干部编制的审核管理工作。
　　机构编制监督检查科
　　负责监督检查全市各级各部门贯彻执行机构编制法律法规和政策规定的情况；负责受理违反机构编制法律法规、政策规定、纪律的检举和投诉，负责机构编制信访工作和"12310"举报电话受理工作，调查核实违规违纪行为并提出处理意见；拟订机构编制执行情况评估的具体办法并组织实施；负责开展机构编制违规违纪行为预防教育，研究探索党政主要领导干部机构编制责任审计办法并组织实施；具体承办全市机构编制实名制动态管理工作，负责市直机关事业单位进人编制审核工作，核发《机构编制审核通知单》，办理人员入减编手续，登记《机构编制管理台帐》，建立机构编制管理人员信息系统，负责全市机构编制统计工作；指导县市区机构编制部门开展监督检查工作；负责机构编制监督检查工作与纪检监察等部门间的协调配合。
　　事业单位登记管理科
　　贯彻落实国家、省有关事业单位登记管理的法律法规和政策规定并组织实施；依法保护核准登记事业单位有关登记事项的合法权益；监督事业单位贯彻落实事业单位登记管理法律、法规和政策规定，依法处理违法行为；指导和监督检查县市区事业单位登记管理工作；负责管辖范围内事业单位的登记管理工作；指导和实施事业单位法人治理结构、绩效评估和年度报告公开工作；组织和实施全市事业单位网上登记管理系统及信息管理工作；负责全市事业单位法人培训工作；开展有关事业单位登记管理的社会服务。
　　机构编制电子政务中心
　　承担全市政务和公益专用中文域名的注册和管理，具体承办全市机构编制实名制动态管理、机构编制统计及市直单位统发工资中的编制审核工作，核发《机构编制审核通知单》，办理人员入减编手续，负责机关门户网站建设、政务信息公开、电子政务和信息化建设等日常工作。